針對農業這一復雜的面源污染以及與地下水的緊密的相互聯系，在原本流域水文過程模擬及點源非點源負荷計算功能的基礎上，增加農業面源地表沖刷模塊，對農田中施肥、沖刷、作物吸收等過程進行機理表達；增加河道中點源污染沖刷降解模塊，近似表達點源集中排放情況下污染物在河道中的累積、自然降解和沖刷過程；另外開發了壤中流/地下水污染物濃度動態模擬模塊、農業施肥灌溉模塊、農業大棚截流模塊等，定制化解決流域水文水質模擬中的各種問題。
